无代码调整聚类热图分支顺序

聚类热图的分支结构会因不同的聚类算法和距离计算方式而有所不同。在保持分支结构不变的前提下，我们有时需要调整热图分支的顺序，以满足特定的需求。这就是文章聚类热图如何按自己的意愿调整分支顺序的出发点。

现在，这种功能已经移植到BIC平台，具体操作如下：

使用之前的绘图数据：

采用默认的绘图参数：

生成的热图效果不错：

现在我们希望调整列的顺序，通常习惯将对照组放在前面，处理组放在后面。我们在colWright列下添加了权重信息，在不影响层级聚类结构的基础上（层级聚类中，哪两个/两组样品在同一分支下是不可改变的，但同一分支下的两个/两组样品谁在左、谁在右是无关紧要的），权重大的列排在左侧，权重小的列排在右侧。

在colWright列下，我们添加了权重信息：

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ID    conditions    individual    SV1    ColWeight
untrt_N61311    untrt    N61311    -0.101    80
untrt_N052611    untrt    N052611    0.018    100
untrt_N080611    untrt    N080611    -0.429    70
untrt_N061011    untrt    N061011    0.535    90
trt_N61311    trt    N61311    -0.125    40
trt_N052611    trt    N052611    0.036    60
trt_N080611    trt    N080611    -0.467    70
trt_N061011    trt    N061011    0.533    50

我们希望的排序顺序为：

untrt_N052611
untrt_N061011
untrt_N61311
untrt_N080611
trt_N080611
trt_N052611
trt_N061011
trt_N61311

拷贝数据并设置参数，主要包括：

• Column used for reorder row cluster branches：选择哪一列作为行聚类排序的权重列
• Column used for reorder column cluster branches：选择哪一列作为列聚类排序的权重列
• Exclude order variable from row annotation：这一列有时是自己编的值，只是拿来美化图，而不希望展示，可以通过该参数隐去
• Exclude order variable from column annotation：这一列有时是自己编的值，只是拿来美化图，而不希望展示，可以通过该参数隐去

提交后获得结果，顺序如我们期望：

如果调整时未达到预期效果，首先检查是否改变了分支结构；如果没有改变结构但依然无效果，则可以尝试加大不同样品权重的差距，以获得预期的排序效果。

这是调整分支顺序的一种方式，文章聚类热图如何按自己的意愿调整分支的顺序还提供了许多其他排序方式可供参考和使用。

以上就是无代码调整聚类热图分支顺序的详细内容，更多请关注其它相关文章！