如何在Windows电脑上使用LDSC软件(2)------LDSC的安装

在上一期的内容中，我们已经完成了linux子系统的安装，今天我们将在linux子系统上安装ldsc，这是一个不小的挑战！！！

以下Linux代码用于升级相关软件：

sudo apt-get update
sudo apt-get install --reinstall build-essential

接下来，下载Anaconda的Linux版本（https://www.php.cn/link/07c4e1bc5b4228901136e90dad3209a2。

LDSC最简单的安装方法是按照官方网站提供的步骤（https://www.php.cn/link/8451dd97e66989d4b6d30d118cb8270e）：

git clone https://www.php.cn/link/8451dd97e66989d4b6d30d118cb8270e.git # 下载ldsc
cd ldsc # 进入ldsc文件夹
conda env create --file environment.yml # 配置ldsc环境
source activate ldsc # 激活ldsc环境
./ldsc.py -h # 查看ldsc程序是否能正常运行
./munge_sumstats.py -h # 查看munge_sumstats是否能正常运行

如果上述步骤无法完成LDSC的安装，建议按照以下教程进行安装：

首先，自行创建一个名为ldsc的工作环境：

conda create --name ldsc
source activate ldsc # 激活并进入ldsc环境

此时，系统的前面会出现(ldsc)这样的小标志，如下图所示：

永利在线企业网站管理系统(CMS)1.0 Build 20100612

修正说明：1，实现真正的软件开源。2，安装界面的美化3，真正实现栏目的递归无限极分类。4，后台添加幻灯片图片的管理，包括添加，修改，删除等。5，修正添加新闻的报错信息6，修正网站参数的logo上传问题7，修正产品图片的栏目无限极分类8，修正投票系统的只能单选问题9，添加生成静态页功能10，添加缓存功能特点和优势1. 基于B/S架构，通过本地电脑、局域网、互联网皆可使用，使得企业的管理与业务不受地域

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如果有代理，建议开启代理，这样可以直接使用bioconda下载相关依赖包。如果无法使用代理，可以使用国内的镜像：

conda config --add channels bioconda
conda config --add channels http://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

接下来，逐步安装所需的软件和安装包：

conda install python=2.7 # 安装python 2.7
conda install pybedtools=0.7 # 安装pybedtools 0.7
conda install nose=1.3 # 安装nose 1.3
conda install bitarray=0.8 # 安装 bitarray 0.8
pip install scipy==0.18 # 安装scipy 0.18
pip install pandas==0.20 # 安装pandas 0.20
pip install numpy==1.16 # 安装numpy 1.16
export PATH=~/ldsc:$PATH # 配置环境变量
echo $PATH

然后，我们输入 ldsc.py -h，如果出现如下页面，说明安装成功：

这样，我们就完成了LDSC的安装，希望能给大家带来帮助。在下一期内容中，我将带大家进行LDSC实例分析和结果解读。

以上就是如何在Windows电脑上使用LDSC软件(2)------LDSC的安装的详细内容，更多请关注其它相关文章！